En el año 2008, mediante el Acuerdo 014, se crea la Facultad de Ciencias Agropecuarias, que integra las antiguas Facultades de Administración de Empresas Agropecuarias, Medicina Veterinaria y Zootecnia con una tradición de más de cincuenta años en la formación de profesionales, así como los posgrados que formaban parte de la División de Formación Avanzada; para dar inicio en 2009 a una nueva y sólida Unidad Académica con una amplia oferta académica actualizada en pregrado, posgrado y educación continuada. En mayo de 2010 se incluyó el programa de Ingeniería Agronómica, en Yopal, perteneciente al proyecto “Utopía”, un concepto único que integra la generación de oportunidades educativas y productivas para jóvenes de sectores rurales, de escasos recursos económicos, y que han sido afectados por la violencia.
La Facultad de Ciencias Agropecuarias promueve la construcción y divulgación de conocimiento socialmente útil y una educación fundamentada en la integridad de la persona, para contribuir así al progreso del sector agropecuario colombiano. Su quehacer se sustenta en los lineamientos institucionales planteados en el Proyecto Educativo Universitario Lasallista (PEUL), como orientador de todos los procesos de la Universidad; en el Sistema de Investigación Universitario Lasallista (SIUL), como promotor en la generación de conocimiento, y en el Enfoque Formativo Lasallista (EFL), como guía del proceso formativo.